هي شعبة مستقلة تابعة لمركز التخطيط الحضري والاقليمي للدراسات العليا تكون مرتبطة بعميد المركز تقوم بتدقيق كافة الاعمال التي تصدر من شعبة الحسابات ومعاملات الصرف فبل الصرف ، وايضاً تقوم بتدقيق كافة الجداول الشهرية التي تصدر من الحسابات وكذلك تدقيق مستندات الصرف والقيود ومطابقة كشف البنك وتدقيق استمارات اجور الارشراف والمحاضرات للسادة التدريسيين ووايضاً تدقيق الرواتب .
تضم هذه الشعبة الوحدات التالية :-
1- وحدة التدقيق السابق للصرف.
2- وحدة تدقيق البيانات المالية والسجلات.
3- وحدة تدقيق العقود.
4- وحدة الرقابة الادارية .
